最近のマイナンバーブーム？？で話題が薄いですが、WindowsServer2003のサポート終了が2015年7月15日、間もなくとなりました。

マイクロソフト告知ページ http://www.microsoft.com/ja-jp/server-cloud/products/windows-server-2003/default.aspx

富士通告知ページ　http://jp.fujitsu.com/platform/server/primergy/solution/win-lifecycle/

サーバーのバージョンアップは結構費用が価格ので掛かるのでもうしばらく様子見って会社もあるのかもしれません。
しかし、そのネットワークに10月から収集を始めるマイナンバーのデータを格納するのはではないですか？

マイナンバーは1件の漏えいから罪に問われ、200万円の罰金など厳罰が課せられます。

その点を考えると早い目のバージョンアップがお勧めです。

マイクロソフトWindowsXPサポート終了告知ページ　http://www.microsoft.com/ja-jp/windows/lifecycle/xp_eos.aspx